上海航空貨物運輸所承運的貨物，由托運方交承運方起，承運方即對所運物負有責任，直至承運方將貨物交收貨方為止，這一段時間稱為承運責任其間。因裝卸、運送、保管、交付過程不妥善，而發生貨物損壞或丟失事故，稱作貨損貨差。上海航空公司是承運人，航空運單是交貨憑證，作為航空運輸代理如外運公司，也有自己的運單(空運上又稱航空分運單)，航空運單和航空分運單背面，均有責任劃分和賠償條款。
一，航空貨物運輸中，如果發生貨損貨差，首先追查責任方，是代理責任還是承運人責任，不論是哪方責任一般均按條款進行賠償，也就是按航空總運單、分運單背面條款進行賠償，一般根據貨物計費重量，最高賠償額為每公斤20美元，其余部分由貨主向保險公司提賠(即貨物在處運前辦理了保險)。
二，進口貨物在卸機后，如有殘損或短少，須在48小時內向飛機承運人提出。
三，外運公司作為貨主代理人，應盡力維護貨主利益，在與上海航空交接貨物時，發現貨物外包裝有破損或件數短少時，應在接貨同時，取得上海航空貨運的商務記錄，屆時憑此向航空公司提出索賠。
四，上海航空快件的運輸與一般貨物運輸一樣也有索賠條款，如果快件在傳遞過程中丟失，也要追查在哪個環節上丟失，責任方在哪里。每份國際快件的最高賠償為100美元。凡是委托外運公司快件代理出口的塊件，如有丟失，外運公司一般免費提供一次寄件。
索賠通知與訴訟時效。根據規定在貨物遭受損害的情況下，收貨人或有關當事人應于收到貨物之日起7天之內提出書面通知。在延遲交貨的情況下，收貨人應于貨物收到之日后14天之內提出索賠通知。如在以上規定期限內沒有提出，則作為托運人放棄該項索賠。因此，首先應該明確那些索賠是上海航空貨運的受理范圍內。